Филогенетические деревья. Занятие 1

Задание 1

Цель занятия: поработать с филогенетическим деревом нескольких бактерий.

НазваниеМнемоника
Bacillus anthracisBACAN
Bacillus subtilisBACSU
Clostridium botulinumCLOB1
Clostridium tetaniCLOTE
Enterococcus faecalisENTFA
Finegoldia magnaFINM2
Geobacillus kaustophilusGEOKA
Lactobacillus acidophilusLACAC
Lactobacillus delbrueckiiLACDA
Lactococcus lactisLACLM
Listeria monocytogenesLISMO
Pediococcus pentosaceusPEDPA
Staphylococcus aureusSTAA1
Staphylococcus epidermidisSTAES
Streptococcus pyogenesSTRP1
Streptococcus pneumoniaeSTRPN
Thermoanaerobacter tengcongensisTHETN

Из данного списка выбрала 7 бактерий.

Отобранные бактерии


НазваниеМнемоника
Bacillus subtilisBACSU
Clostridium tetaniCLOTE
Enterococcus faecalisENTFA
Lactococcus lactisLACLM
Listeria monocytogenesLISMO
Staphylococcus epidermidisSTAES
Thermoanaerobacter tengcongensisTHETN

Скобочная формула дерева

((CLOTE,THETN),((ENTFA,LACLM),((BACSU,LISMO),STAES)));

Изображение дерева

Ветви дерева

Дерево содержит нетривиальные ветви:
1){CLOTE,THETN} против {ENTFA,LACLM,BACSU,LISMO,STAES}
2){ENTFA,LACLM} против {CLOTE,THETN,BACSU,LISMO,STAES}
3){BACSU,LISMO,STAES} против {CLOTE,THETN,ENTFA,LACLM}
4){BACSU,LISMO} против {STAES,CLOTE,THETN,ENTFA,LACLM}

Главная страница
Страница четвертого семестра

© Naraykina Yulya,2011